Thông qua câu chuyện cuộc đời của tác giả bộ binh pháp Tôn tử nổi tiếng: Tôn Vũ, bộ phim Tôn Tử Đại truyện khắc họa cảnh Xuân thu chiến quốc với sự phân tranh khốc liệt của các thế lực cùng những tình yêu, tình bạn trong thời loạn thế.
Cô gái mồ côi Phùng Phong xuyên không về cổ đại, trở thành tần phi Phùng Diệu Liên của hoàng đế Lý Hoan. Những suy tính phức tạp trong chốn cung đình cùng đủ loại dày vò của hoàng đế khiến cho Phùng Phong cảm thấy tuyệt vọng sâu sắc. Cô ấy trở thành phi tần bị vứt bỏ, ở trong từ đường dưỡng bệnh đã đem lòng yêu Quốc sư suy nghĩ đơn thuần Gia Diệp.
Đệ tử phái Vân Thương tên Cổ Phong và Đoạn Hải vì muốn phá giải Ngọc nữ thần công của phản đồ Cổ Diễm Phương, lén ăn cắp bí cấp cổ truyền thất bại, Phong bị trục xuất sư môn. Hải thấy thẹn, nuôi dưỡng Đoạn Ngọc Lâu, con của Phong và dối xử còn tốt hơn con mình là Đoạn Phi. Lâu bẩm tính cao ngạo, vì muốn xưng bá võ lâm đã lợi dụng người yêu và tu luyện Ngọc nữ thần công và trở thành một đại cuồng ma
Nhiếp Khuynh Thành, để kiếm sống nuôi cả gia đình đã trở thành vũ nữ nổi tiếng nhất ở Bến Thượng Hải. Thể chất bán yêu của Khuynh Thành khiến những người xung quanh đều bị tổn hại, người thân vì cô mà chết, cô buộc lòng phải phản kháng. Nhờ cơ duyên may mắn cô quen biết với công tử nhà phú gia Minh Hạ, hai người nảy sinh một mối tình nhân - yêu tuyệt luyến.
Khi thế tôn bị hành thích, vương muội song sinh đóng giả ngài để lên ngôi trong khi cố gắng giữ kín bí mật vương thất về thân phận và mối tình đầu của nàng.