Câu chuyện diễn ra tại một thế giới có những loài vật tên "Spiral" được sinh ra từ sự cô độc. Những người có khả năng đánh bại chúng được gọi là các "Period". Haru là một Period học việc trong Sư Đoàn 8 Arc End. Tuy nhiên, sau một vụ cướp bí ẩn, nền kinh tế bỗng sụp đổ, và trụ sở Arc End giải tán Sư Đoàn 8, để lại mỗi 3 Period, trong đó có Haru.
Các Pillars bất ngờ xuất hiện trên Trái đất, gây ra mối đe dọa cho tất cả các dạng sống. Hết cách để tự bảo vệ mình, nhân loại đang đứng trên bờ vực diệt vong, nhưng một vị thần tên là Odin đã cho họ một con đường để cứu rỗi.
câu chuyện lấy bối cảnh ở một thị trấn ven biển của Moriah,khi mà bọn tội phạm đang lộng hành,chúng lợi dụng một nơi thờ tự một vật cổ đại để làm nơi ẩn nấu,hoạt động phạm tội ngày một dày đặc và gây hoang mang trong lòng những người dân nơi đây.
Ngôi làng của Shu bị tấn công bởi những tên địch, cậu ta và bạn mình, Jiro và Kluke quyết định bảo vệ quê nhà. Họ sớm gặp chiến binh Zola và nhận được năng lượng của Shadow, khả năng biến những bóng của họ thành những quái vật siêu phàm. Shu nhận được quái vật có sức mạnh ghê gớm nhất, Blue Dragon, và họ cùng nhau chiến đấu chống lại kẻ thù.
Câu chuyện bắt đầu khi cậu bé Shindou Hikaru tình cờ đến nhà ông nội và bắt gặp 1 chiếc bàn cờ vây cổ, không ai nhìn thấy vết máu trên bàn cờ ngoài cậu. Sau đó, cậu đã gặp Fujiwara no Sai, 1 kỳ thủ cờ vây đến từ thời đại Heian, vốn là 1 người dạy cờ vây cho nhà vua, nhưng bị 1 người dạy cờ khác ganh ghét hãm hại, nên bị đuổi khỏi thành.