Câu chuyện nói về năm cô gái chiến đấu với một nhiệm vụ đặc biệt trong máy bay của sự tồn tại ở phía bên kia của màn hình. Các thiết lập của câu chuyện là khu vực đô thị của thủ đô Nhật Bản.
Cuộc gặp gỡ đầu tiên của cô với Toriko Nishina là ở bên kia thế giới sau khi thấy “thứ đó” và nó gần như sắp chết. Kể từ ngày đó, cuộc sống của sinh viên đại học Sorawo Kamikoshi lâm vào bế tắc.
Một trung úy trẻ của Zeon, Bernie, đã bí mật thâm nhập khu vực Colony số 6, tại đó, anh ta đã gặp Al, một cậu bé ngây thơ. Hai người trở thành bạn và rồi Bernie bắt đầu thích người hàng xóm của Al, Chris, một nữ phi công lái Gundam, thứ Bernie đang tìm cách tiêu diệt.
Lấy bối cảnh thế giới nơi nhân loại mất quyền kiểm soát đại dương vào tay "hạm đội biển sâu", hi vọng duy nhất chống lại hiểm họa này là những Kanmusu, một nhóm những cô gái mang trong mình linh hồn chiến hạm Nhật Bản.
Vào năm UC 79, con người sống trên các colony không gian gọi là side. Side 3, công quốc Zeon, đã phát động chiến tranh với Liên Bang Trái Đất. Sau những trận đánh ko cân sức , 8 tháng dài vào thế kẹt.